本发明提供了一种简单有效的水冷型质子交换膜燃料电池热管理系统及其控制方法,热管理系统主要包括:电堆、带有加热装置的水箱、冷却水循环泵、散热器、冷却水入堆温度传感器、冷却水出堆温度传感器、冷却水入堆压力传感器、热管理系统的控制器。控制方法上,针对传统的控制策略跟踪温度的变化造成的滞后、超调量大、系统耦合等缺点,提出一种跟随压力变化的控制方法。其中,散热器主要用于控制电堆冷却水入口温度,主要是根据燃料电池电堆冷却水入口温度来控制散热风扇的转速;冷却水循环泵主要用于控制整个热管理系统中的冷却水流量,主要根据燃料电池电堆冷却水入口压力来控制循环泵的转速。